Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX7O95931 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX7O95931 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms