Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSL3O95573 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms