Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP19O94966 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP19O94966 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP19O94966 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP19O94966 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
USP19O94966 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP19O94966 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP19O94966 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms