Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG12O94817 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms