Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECM2O94769 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM2O94769 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM2O94769 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms