Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN15O75808 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms