Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRP5O75197 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRP5O75197 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRP5O75197 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRP5O75197 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRP5O75197 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms