Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms