Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN2BO60939 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms