Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms