Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTATSF1O43719 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms