Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms