Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC7A4O43246 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms