Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRXO43186 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRXO43186 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRXO43186 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRXO43186 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CRXO43186 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRXO43186 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRXO43186 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRXO43186 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRXO43186 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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