Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF6O14896 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF6O14896 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF6O14896 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF6O14896 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IRF6O14896 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF6O14896 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF6O14896 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF6O14896 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms