Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIT3O14879 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms