Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFKBIEO00221 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms