Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms