Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E9PMD0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E9PMD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E9PMD0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E9PMD0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E9PMD0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E9PMD0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
E9PMD0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
E9PMD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms