Protein–RNA interactions for Protein: E9PAM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PAM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E9PAM4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E9PAM4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E9PAM4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E9PAM4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms