Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E5RI56 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E5RI56 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E5RI56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E5RI56 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E5RI56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms