Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms