Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms