Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms