Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MTMR11A4FU01 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms