Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PA2G4P4-201ENST00000473864 1182 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF192P2-201ENST00000402215 1383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3E-202ENST00000427262 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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