Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYAB-216ENST00000616970 977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC244093.5-201ENST00000619606 718 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 OR7A17-203ENST00000642123 3565 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ATG4A-203ENST00000372232 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM28-202ENST00000437154 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CCRL2-204ENST00000400882 1642 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC4C-203ENST00000528697 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NCAPH-202ENST00000427946 2363 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CLIP1-214ENST00000540539 2592 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 DAPP1-201ENST00000296414 2955 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN31-202ENST00000396838 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 NXF5-205ENST00000473265 1348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003027.1-202ENST00000366160 2076 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms