Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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TMIEQ8NEW7 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TMIEQ8NEW7 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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