Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 XRCC6P1-201ENST00000420392 1805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL022329.1-201ENST00000412773 488 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TGFB2-AS1-201ENST00000414452 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC011474.3-201ENST00000587520 250 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MCTP1-201ENST00000312216 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC114786.2-201ENST00000510090 1426 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CNR1-204ENST00000428600 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL137784.1-201ENST00000407121 745 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINCMD1-201ENST00000418518 462 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms