Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms