Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IMPG1Q17R60 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms