Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NRF1Q16656 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms