Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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