Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFFO1Q0D2I5 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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