Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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