Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms