Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDCD1Q15116 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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