Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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