Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
KCNAB1Q14722 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms