Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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