Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC089998.3-201ENST00000549715 493 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SLC36A3-201ENST00000335230 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNCA-206ENST00000420646 3127 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MOBP-201ENST00000311042 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 IKZF2-202ENST00000374319 2001 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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