Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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SRSF5Q13243 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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