Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms