Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APCP25054 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APCP25054 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APCP25054 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APCP25054 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APCP25054 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APCP25054 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
APCP25054 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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