Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPREP23469 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PTPREP23469 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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PTPREP23469 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
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