Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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