Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms