Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TIGIT-201ENST00000383671 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SFTPB-201ENST00000393822 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1D-12-201ENST00000377032 371 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD4P2-201ENST00000431135 420 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590440.1-201ENST00000436960 428 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL51P2-201ENST00000450190 376 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1-12-201ENST00000480492 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00511-204ENST00000577828 538 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MERTK-201ENST00000295408 3954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms