Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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COL24A1Q17RW2 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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