Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms